药用植物区始建于1997年，占地约2万多平方米。自2000年12月18日对外开放以来。目前已收集栽种了来自华南、西南、华中、华东等地区的药用植物141科408属1028种。其中蕨类植物16科28属48种，裸子植物5科8属8种，被子植物120科372属种。全区按植物的药用功能分为：补益类、清热解毒类、解表类、活血祛瘀类、祛风湿类、抗肿瘤类、芳香化湿类等十几个小区，其中不乏常见及著名的药用植物如甘草、骨碎补、大黄、半枫荷、石斛、砂仁、白芨、使君子、百部、贝母、巴戟、杜仲、地黄等。此外，区内还专门设置中草药标本陈列室，展出近300种中草药材标本和腊叶标本。